<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<report xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema">
    <protocol>
        <meta>
            <protocolNaam>Moleculairebepalingen</protocolNaam>
        </meta>
        <content>
            <rubriek naam="moduleimport">
                <session>
                    <data>
                        <item>
                            <path>importgeneset.genesetmeta.ngs_reference_number</path>
                            <values>
                                <value>ID1234</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[1].build</path>
                            <values>
                                <value>hg19</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[1].chr</path>
                            <values>
                                <value>7</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[1].start</path>
                            <values>
                                <value>55249071</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[1].ref</path>
                            <values>
                                <value>C</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[1].alt</path>
                            <values>
                                <value>T</value>			
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[1].coverage</path>
                            <values>
                                <value>111111</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[1].frequency</path>
                            <values>
                                <value>10.9</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[1].gene</path>
                            <values>
                                <value>EGFR</value>		
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[1].transcript</path>
                            <values>
                                <value>NM_005228.4</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[1].exon</path>
                            <values>
                                <value>19</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[1].coding</path>
                            <values>
                                <value>c.2369C>T</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[1].protein</path>
                            <values>
                                <value>p.Thr790Met</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[1].klasse</path>
                            <values>
                                <value>3</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[2].build</path>
                            <values>
                                <value>hg19</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[2].chr</path>
                            <values>
                                <value>7</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[2].start</path>
                            <values>
                                <value>55242469_55242488</value>	
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[2].ref</path>
                            <values>
                                <value>TTAAGAGAAGCAACATCTCC</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[2].alt</path>
                            <values>
                                <value>CA</value>			
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[2].coverage</path>
                            <values>
                                <value>2111</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[2].frequency</path>
                            <values>
                                <value>70</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[2].gene</path>
                            <values>
                                <value>EGFR</value>										
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[2].transcript</path>
                            <values>
                                <value>NM_005228.4</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[2].exon</path>
                            <values>
                                <value>19</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[2].coding</path>
                            <values>
                                <value>c.2239_2258delinsCA</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[2].protein</path>
                            <values>
                                <value>p.Leu747_Pro753delinsGln</value>
                            </values>
                        </item> 
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[2].klasse</path>
                            <values>
                                <value>5</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[3].build</path>
                            <values>
                                <value>hg19</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[3].chr</path>
                            <values>
                                <value>7</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[3].start</path>
                            <values>
                                <value>55249012_55249013</value>							
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[3].ref</path>
                            <values>
                                <value></value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[3].alt</path>
                            <values>
                                <value>GGGGTT</value>		
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[3].coverage</path>
                            <values>
                                <value>2260</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[3].frequency</path>
                            <values>
                                <value>41</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[3].gene</path>
                            <values>
                                <value>EGFR</value>		
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[3].transcript</path>
                            <values>
                                <value>NM_005228.4</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[3].exon</path>
                            <values>
                                <value>20</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[3].coding</path>
                            <values>
                                <value>c.2310_2311insGGGGTT</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[3].protein</path>
                            <values>
                                <value>p.Asp770_Asn771insGlyVal</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[3].klasse</path>
                            <values>
                                <value>5</value>
                            </values>
                        </item>
 			       <item>
                            <path>importgeneset.line[4].build</path>
                            <values>
                                <value>hg19</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[4].chr</path>
                            <values>
                                <value>4</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[4].start</path>
                            <values>
                                <value>55593624_55593668</value>								
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[4].ref</path>
                            <values>
                                <value>AATGGAAACAATTATGTTTACATAGACCCAACACAACTTCCTTAT</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[4].alt</path>
                            <values>
                                <value></value>			
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[4].coverage</path>
                            <values>
                                <value>5174</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[4].frequency</path>
                            <values>
                                <value>30</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[4].gene</path>
                            <values>
                                <value>KIT</value>		
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[4].transcript</path>
                            <values>
                                <value>NM_000222.2</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[4].exon</path>
                            <values>
                                <value>11</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[4].coding</path>
                            <values>
                                <value>c.1690_1734delAATGGAAACAATTATGTTTACATAGACCCAACACAACTTCCTTAT</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[4].protein</path>
                            <values>
                                <value>p.Asn564_Tyr578del</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[4].klasse</path>
                            <values>
                                <value>5</value>
                            </values>
                        </item>
			       <item>
                            <path>importgeneset.line[5].build</path>
                            <values>
                                <value>hg19</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[5].chr</path>
                            <values>
                                <value>12</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[5].start</path>
                            <values>
                                <value>25398284</value>	
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[5].ref</path>
                            <values>
                                <value>G</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[5].alt</path>
                            <values>
                                <value>A</value>			
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[5].coverage</path>
                            <values>
                                <value>50</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[5].frequency</path>
                            <values>
                                <value>32</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[5].gene</path>
                            <values>
                                <value>KRAS</value>		
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[5].transcript</path>
                            <values>
                                <value>NM_004985.4</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[5].exon</path>
                            <values>
                                <value>2</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[5].coding</path>
                            <values>
                                <value>c.35G>A</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[5].protein</path>
                            <values>
                                <value>p.Gly12Asp</value>
                            </values>
                        </item>
                        <item>
                            <path>importgeneset.line[5].klasse</path>
                            <values>
                                <value>5</value>
                            </values>
                        </item>
						<item>
                            <path>importcnvset.CNVline[1].CNVexport</path>
                            <values>
                                <value>true</value>
                            </values>
                        </item>
						<item>
                            <path>importcnvset.CNVline[1].CNVgene</path>
                            <values>
                                <value>EGFR</value>
                            </values>
                        </item>
						<item>
                            <path>importcnvset.CNVline[1].type_aberratie</path>
                            <values>
                                <value>amplificatie</value>
                            </values>
                        </item>
						<item>
                            <path>importcnvset.CNVline[1].aantal_kopieen</path>
                            <values>
                                <value>5</value>
                            </values>
                        </item>
						<item>
                            <path>importcnvset.CNVline[1].rel_coverage</path>
                            <values>
                                <value>10</value>
                            </values>
                        </item>
						<item>
                            <path>importcnvset.CNVline[1].z_score</path>
                            <values>
                                <value>8</value>
                            </values>
                        </item>
                    </data>
                </session>
            </rubriek>
        </content>
    </protocol>
</report>
